만주에 위치한 비밀 부대, 731. 그곳에서 조선인과 중국인 포로들은 ‘마루타’라 불리며 이름조차 지워진 채 인간 생체 실험의 대상으로 소모된다. 끝없이 반복되는 실험과 죽음 속, 양심의 가책에 시달리던 일본인 군의관은 이 지옥 같은 현실을 끝내기 위한 위험한 선택을 결심한다. 탈출과 폭로, 그리고 복수를 둘러싼 계획은 점점 거대한 비극으로 번져가고 부대 전체를 뒤흔드는 사건으로 이어진다. 충격 실화를 바탕으로 한 영화 <마루타>의 뒤를 잇는 이야기, <마루타 디 오리지널: 살인공창> 끝나지 않은 잔혹한 기록이 다시 시작된다.